染色质研究ChIP工作流程

简化染色质研究工作流程，以说明示例研究的进展情况以及支持这些步骤的EpiGentek试剂盒

什么是染色质免疫沉淀（ChIP）？

研究染色质相关修饰的最广泛使用的方法之一是染色质免疫沉淀（ChIP），这是一种感兴趣的蛋白质与特定基因组DNA区域结合的过程。这种流行的ChIP检测为表观遗传学研究人员提供了有关某些蛋白质或蛋白质修饰与特定DNA序列之间相互作用的宝贵信息。

蛋白质-DNA相互作用对某些细胞功能如DNA复制和重组、基因转录、染色体分离、信号转导和表观遗传沉默至关重要。例如，了解蛋白质-DNA相互作用可以用于比较两个不同组（如患病或健康组织）中与特定基因启动子区域相关的组蛋白甲基化的量。染色质免疫沉淀方法也可用于绘制各种其他组蛋白修饰的基因组位置。

ChIP适合您的实验吗？

由于染色质免疫沉淀和各种下游应用可能需要时间并伴随着相关费用，因此值得了解ChIP是否适合您的研究。

在开始之前，我们建议您先回顾一下与您所提议的实验相关的现有文献。有些时候，其他研究人员已经完成了跑腿的工作，这给了你一个坚实的基础，你可以开始研究，而不必重新发明轮子。从这里开始，你的团队可以采取各种变化和独特的角度，使研究变得有趣，独特和有价值，同时回顾以前完成的工作，发现以前的研究人员面临的任何潜在障碍或问题。让别人的经验对你有利，这样你就可以提前保存自己学习的时间和头痛。

最后，研究人员可能已经对您的目标进行了ChIP，因此可以保存大量宝贵的时间和精力。可以找到此类信息的一些最常见的资源包括USCS基因组浏览器，ENCODE项目和NCBI。一定要检查这些资源的信息之前，进行您的研究，看看工作是否已经完成。如果没有，并且您的目标尚未阐明，那么进行ChIP实验可能是您研究的正确解决方案。

1、染色质分离

染色质是DNA和蛋白质的组合，将DNA包装成较小的体积以适应细胞，有助于防止DNA损伤，并控制基因表达和DNA复制。染色质样品的适当分离是研究蛋白质-DNA相互作用的测定中的重要因素。EpiGentek的专有染色质分离试剂盒确保使用各种方法从哺乳动物或植物细胞和组织中提取染色质，以确保完整染色质的高质量分离。

2、染色质可及性

染色质结构是基因调控的一个重要决定因素，其中一个主要因素是染色质对转录因子和其他DNA结合蛋白的可及性。一般来说，染色质越浓缩，转录因子和其他DNA结合蛋白就越难接近DNA并执行其任务。DNA越容易接近，周围的基因就越有可能被活跃地转录。研究染色质结构的可及性对于提供核小体存在或不存在的信息特别感兴趣，核小体直接或间接影响一系列其他细胞和代谢过程。

3、染色质断裂

染色质样品的超声能量处理是酶消化方法的广泛接受的替代方法。通过在我们的超声技术中强调更高的通量处理和防止样品污染，我们的EpiSonic™超声仪可以轻松集成到现有的实验室工作流程中，并且特别适合与表观遗传和下一代应用兼容。

4、染色质免疫沉淀（ChIP）

由于蛋白质-DNA相互作用在细胞功能中起着至关重要的作用，因此识别DNA结合蛋白的遗传靶标并了解蛋白质-DNA相互作用的机制对于理解细胞过程至关重要。研究人员研究这些相互作用的工具之一是染色质免疫沉淀或ChIP。与其他方法相比，ChIP的优势在于该过程允许检测与活细胞中基因的特定序列结合的特定蛋白质。EpiGentek提供一系列检测试剂盒解决方案，帮助您的实验室高效、准确、重复地进行成功的ChIP实验。