我们提供最全面的DNA甲基化研究产品,涵盖从上游到下游的实验工作流程的每一步。
什么是DNA甲基化?
DNA甲基化通过DNA甲基转移酶(DNMT)在胞嘧啶环的5-碳上共价添加甲基(CH3)而发生,产生5-甲基胞嘧啶(5-mC)。当基因启动子区域的CpG岛被甲基化时,基因的表达被抑制。当DNA甲基化没有正确建立和/或维持时,会发生几种人类疾病,如癌症。
DNA甲基化是一个动态和可逆的过程,可以导致几种中间修饰形式。通过DNMT从胞嘧啶转化的5-mC可以通过泰特酶羟基化为5-羟甲基胞嘧啶(5-hmC)。5-hmC被相同的泰特酶进一步修饰为5-甲酰胞嘧啶(5-fC)和5-羧基胞嘧啶(5-caC)。DNA甲基化分析对于理解和靶向DNA甲基化相关变化至关重要,这将有助于识别DNA甲基化标记及其生物学调控。
哪种DNA甲基化工具适合您的实验?
有几种方法可用于分析全基因组和区域特异性DNA甲基化。虽然成本、最低样品输入要求、准确度、快速性和通量是重要的考虑因素,但选择正确的方法对分析的成功至关重要。
在你开始之前,我们建议你先回顾一下与你的实验相关的文献。如果其他研究人员已经完成了这项工作,你也可以利用这些可用的信息作为基础来建立你的研究。然后,您和您的团队可以使用变化和独特的角度来使研究变得不同和有趣,仔细审查以前完成的工作,以确定以前的研究人员遇到的潜在障碍或问题。
如果您不确定哪种方法适用于您的研究,我们建议您从样本中的整体DNA甲基化和羟甲基化状态的简单预筛选开始。
(1)通过使用快速的整体DNA甲基化或羟甲基化检测,您可以评估您的样品是否含有5-mC或5-hmC以及含量。然后,您可以确定下一步以及使用哪种方法。
(2)如果您发现您的样本同时含有5-mC和5-hmC,则可以使用氧化亚硫酸氢盐测序。该方法可以在全基因组范围内以单碱基分辨率识别和区分5-mC和5-hmC。如果仅检测到5-mC,而几乎没有或没有5-hmC,则可以执行传统的WGBS或RRBS。
(3)如果样品量有限或需要单细胞水平的分析,亚硫酸氢盐后测序可以满足要求。
(4)为了分析特定基因组(例如癌症基因组或多个基因组区域)的甲基化/羟甲基化,靶向亚硫酸氢盐测序或靶向氧化亚硫酸氢盐测序将起作用。
DNA甲基化研究步骤详情
DNA分离
DNA样品可以从细胞、组织和体液中制备,并且是大多数DNA甲基化应用和测定最常用的起始材料。高效、精确和高质量的DNA分离是成功进行基于DNA的实验的关键前提。
目录号
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名称
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描述
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P-1018
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全血及培养细胞DNA提取试剂盒
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用于从血液白细胞和培养的哺乳动物细胞中快速分离纯基因组DNA
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P-1003
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FITTIONAL通用组织切片DNA分离试剂盒
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用于分离载玻片上任何目标显微组织区域中的DNA
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P-1004
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健康人血浆/血清DNA分离试剂盒
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用于从显微切割样品、新鲜组织切片、福尔马林固定和石蜡包埋的组织、血浆、血清、体液等中分离微量DNA。
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P-1065
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EpiQuik循环游离DNA(ccfDNA)分离简易试剂盒
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用于从血浆或血清中分离小片段循环ccfDNA
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甲基化DNA定量
DNA甲基化在高等生物的正常发育和细胞分化中起着至关重要的作用。基因表达和几乎所有类型癌症的发展也与DNA甲基化有关。例如,5-甲基胞嘧啶含量的整体降低(DNA低甲基化)可能是由于各种环境影响导致的甲基缺乏引起的,并且已被提议作为多种生物过程(如癌症)中的分子标记。DNA甲基化的整体定量对于理解基因表达和沉默在癌症发展和其他疾病中的作用至关重要。
目录号
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名称
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描述
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P-1030
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MethylFlash Global DNA甲基化(5-mC)ELISA Easy Kit
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用于通过一步ELISA方法定量整体DNA甲基化
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P-1032
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MethylFlash Global DNA羟甲基化(5-hmC)ELISA Easy Kit
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用于通过一步ELISA方法定量整体DNA羟甲基化
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P-1041
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MethylFlash 5-甲酰胞嘧啶(5-fC)DNA定量试剂盒
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用于以ELISA样形式对总体5-甲酰胞嘧啶水平进行基于吸光度的定量
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亚硫酸氢盐转化
基于亚硫酸氢盐和亚硫酸氢钠的技术,通常称为亚硫酸氢盐转化,是制备用于基因特异性DNA甲基化分析的DNA的常用方法。用亚硫酸氢盐处理DNA将胞嘧啶转化为尿嘧啶,同时保留5-甲基胞嘧啶完整,提供了有关DNA甲基化区域的单核苷酸分辨率信息。亚硫酸氢盐处理后,在基因特异性基础上分析DNA甲基化的流行方法包括亚硫酸氢盐测序、甲基化特异性PCR和基于甲基化的微阵列。
目录号
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名称
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描述
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P-1026
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BisulFlash DNA修饰试剂盒
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用于快速亚硫酸氢盐处理DNA,仅需30分钟即可进行甲基化特异性PCR分析
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P-1001
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Methylamp DNA修饰试剂盒
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用于甲基化胞嘧啶分析的DNA的稳健、基于化学的亚硫酸氢盐转化
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P-1016
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Methylamp全细胞亚硫酸氢盐修饰试剂盒
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直接从细胞、组织、唾液、尿液或血液中进行亚硫酸氢盐转化
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P-1067
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BisulPlus Loci 5mC 5hmC检测PCR试剂盒
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使用少量输入DNA通过PCR同时可靠地检测5hmC和5mC
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DNA片段化
DNA样品的超声能量处理被广泛接受为比酶消化方法更好的替代方法。通过在我们的超声技术中强调更高的通量处理和防止样品污染,我们的EpiSonic™超声仪可以轻松集成到现有的实验室工作流程中,并且特别适合与表观遗传和下一代应用兼容。
目录号
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名称
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描述
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用于下一代测序应用中的DNA和染色质的多样本剪切
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甲基化DNA免疫沉淀
甲基化DNA免疫沉淀(Methylated DNA immunoprecipitation,meDIP)是一种大规模的基于抗体的技术,用于富集和捕获甲基化DNA片段,用于全基因组范围内的基因特异性DNA甲基化研究。在meDIP方法之后,可以使用各种下游应用(包括meDIP-PCR、meDIP-ChIP和meDIP测序)来分析DNA甲基化。
目录号
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名称
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描述
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P-1015
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Methylamp甲基化DNA捕获(MeDIP)试剂盒
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用于富集和捕获甲基化DNA片段,用于微阵列、PCR或NGS应用
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P-1052
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EpiQuik MeDIP超套件
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用于微阵列、PCR或NGS应用中甲基化DNA片段的抗体捕获
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P-2020
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EpiQuik组织甲基化DNA免疫沉淀试剂盒
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用于从各种哺乳动物组织中富集和捕获甲基化DNA,用于微阵列、PCR或NGS应用
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P-1038
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EpiQuik羟甲基化DNA免疫沉淀(hMeDIP)试剂盒
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用于微阵列、PCR或NGS应用中基于抗体的羟甲基化DNA片段捕获
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PCR NGS分析
下一代测序(NGS)技术增加了数据输出量,降低了DNA测序成本,超出了标准染料终止剂方法的可能性。NGS在理解几种表观遗传机制方面取得了重大进展,即全基因组DNA甲基化和蛋白质-DNA相互作用。EpiGentek为下一代测序提供了许多廉价的解决方案,包括全套试剂盒,可以从少量或困难的样品中方便地构建高质量的DNA文库。
目录号
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名称
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描述
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P-1028
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Methylamp MS-qPCR快速试剂盒
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用于进行快速、特异、灵敏和可重复的甲基化特异性定量PCR
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P-1029
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EpiQuik定量PCR快速试剂盒
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用于ChIP、hmeDIP、meDIP和meRIP DNA的实时定量PCR分析
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P-1053
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EpiNext高灵敏度DNA文库制备试剂盒(Illumina)
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用于从非常少量的样品制备DNA文库,以用于下一代测序应用
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P-1055
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EpiNext后亚硫酸氢盐DNA文库制备试剂盒(Illumina)
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用于直接从亚硫酸氢盐处理的DNA构建Illumina兼容文库,用于Methyl-Seq
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P-1056A
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EpiNext高灵敏度亚硫酸氢盐测序试剂盒(Illumina)
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用于从低输入DNA进行简化的亚硫酸氢盐测序NGS文库制备
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P-1063
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EpiNext DNA纯化HT系统
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用于DNA文库制备、大小选择和清理应用中的DNA磁珠分离
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DNA甲基化抗体
经过充分表征和高度验证的DNA甲基化抗体和DNA去甲基化抗体可能有助于增加研究人员对DNA甲基化及其参与疾病和细胞周期调控以及胚胎发育的理解。DNA甲基化是研究最广泛的调节基因表达的表观遗传机制,从而影响细胞功能,而异常DNA甲基化在许多疾病中普遍存在,特别是癌症。
目录号
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名称
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描述
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A-1014
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5-甲基胞嘧啶(5-mC)单克隆抗体[33 D3]
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用于需要对甲基化胞嘧啶具有高特异性的基于抗体的应用
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A-1018
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5-羟甲基胞嘧啶(5-hmC)单克隆抗体[HMC/4D 9]
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用于需要对羟甲基化胞嘧啶具有高特异性的基于抗体的应用
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C20000
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DNA甲基化抗体试剂盒I
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使用一系列精选抗体研究DNA甲基化
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